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电机工程与计算机科学

教职员工

Hani Zakaria Girgis 博士

计算机科学副教授

外汇知识

美国国立卫生研究院：2014 年 XNUMX 月博士后奖学金
约翰霍普金斯大学：2009 年 XNUMX 月博士后奖学金
纽约州立大学布法罗大学：博士，计算机科学，2008 年 XNUMX 月
计算机科学硕士，2005 年 XNUMX 月
BA，生物学和计算机科学，2003 年 XNUMX 月

工作经验

助理教授：Texas A&M University-Kingsville 2019 年 XNUMX 月至今
助理教授：塔尔萨大学 2014 年 2019 月 – XNUMX 年 XNUMX 月

期刊出版物

  1. A. Zielezinski, HZ Girgis, G. Bernard, C.-A. Leimeister, K. Tang, T. Dencker, J.-J. Choi, MS Waterman, S.-H. Kim, S. Vinga, J. Almeida, C.-X. Chan、BT James、F. Sun、B. Morgenstern 和 WM Karlowski。 无比对序列比较方法的基准测试。 基因组生物学，20（1）：144，2019。
  2. A. Velasco II、BT James、VD Wells、HZ Girgis。 Look4TRs：一种使用自监督隐马尔可夫模型检测简单串联重复的从头工具。 生物信息学，btz551，2019。
  3. JD 瓦伦西亚和 HZ Girgis。 LtrDetector：用于从头检测长末端重复逆转录转座子的工具套件。 BMC 基因组学，20：450，2019 年。
  4. HZ Girgis, A. Velasco II, ZE Reyes。 HebbPlot：一种用于学习和可视化染色质标记特征的智能工具。 BMC 生物信息学，19:310，2018 年。
  5. BT James、BB Luczak 和 HZ Girgis。 MeShClust：用于聚类 DNA 序列的智能工具。
  6. 核酸研究，gky315，2018 年。
  7. BB Luczak、BT James 和 HZ Girgis。 在无比对序列比较中基于直方图的统计的调查和评估。 生物信息学简报，bbx161，2017 年。
  8. HZ吉尔吉斯。 红色：一种智能、快速、准确的工具，用于在基因组规模上从头检测重复。
  9. BMC 生物信息学，16（1）：227，2015 年。
  10. A. Visel、L. Taher、HZ Girgis、MJ Blow、JA Akiyama 等。 发育中的端脑的高分辨率增强子图谱。 细胞，152（4）：895-908，2013 年。
  11. HZ Girgis 和 S. Sheetlin。 MsDetector：针对 DNA 微卫星检测的标准计算工具。 核酸研究，41(1):e22，2013 年。
  12. HZ Girgis 和 I. Ovcharenko。 使用同时出现的基序对预测人类基因组中的组织特异性顺式调控模块。 BMC 生物信息学，13(1):25，2012。

同行评审会议出版物

  1. HZ Girgis、BR Mitchell、T. Dassopoulos、G. Mullin 和 G. Hager。 一种在无线胶囊内窥镜视频中检测克罗恩病炎症的智能系统。 在 IEEE 国际生物医学成像研讨会论文集，第 1373-1376 页，2010 年。
  2. HZ Girgis、JJ Corso 和 D. Fischer。 用于选择和排序最佳预测蛋白质结构的通用线性模型的在线层次结构。 在 IEEE 医学和生物学工程学会年度国际会议论文集，第 4949-4953 页，2009 年。
  3. S. Seshamani、P. Rajan、R. Kumar、HZ Girgis、G. Mullin、T. Dassopoulos 和 G. Hager。 用于病变匹配的元注册框架。 在医学图像计算和计算机辅助干预国际会议论文集，第 582-589 页，2009 年。
  4. K. Ho¨ller、J. Penne、A. Schneider、J. Jahn、HZ Girgis、J. Gutierrez、T. Wittenberg 和 J. Hornegger。 通过重力相关的内窥镜图像校正抑制基于冲击的误差。 在第五届俄罗斯-巴伐利亚生物医学工程会议论文集，第 43-47 页，2009 年。
  5. HZ Girgis 和 B. Jayaraman。 JavaTA：基于逻辑的 Java 调试器。 在编程环境中基于逻辑的方法研讨会上，卷 abs/cs/0701107，2007。
  6. HZ Girgis、B. Jayaraman 和 P. Gestwicki。 可视化面向对象程序中的错误。 在面向对象编程、系统、语言和应用程序的 ACM SIGPLAN 会议的论文集伴侣中，第 156-157 页，2005 年。

主要研究兴趣

生物信息学、机器学习、计算基因组学、序列分析和非编码 DNA。

主要教学兴趣

生物信息学、机器学习、数据结构、编程语言、软件工程和操作系统。
Hani Zakaria Girgis 博士